Galaxy (sur une instance publique) permet :
Github est conseillé pour y déposer :
Quels outils sont dédiés au mapping de données RNAseq sur une référence ?
Le séquençage illumina en paired-end permet :
La qualité d’une base d’une base dans un fichier FASTQ :
Dans un fichier SAM, le FLAG permet de savoir :
En RNAseq, il est généralement préférable d’avoir des réplicats qu’une grande profondeur de séquençage ?
À quoi sert le séquençage orienté (“stranded”) ?
Quelles sont les techniques couramment utilisées pour acquérir des données en métabolomique?
Avec quelle technologie de séquençage est il possible de faire du séquençage d’ARN direct ?
J’ai généré 2 000 000 de paires de lectures de 150 ncucléotides. La taille estimée de mon génome est 5 Mb. Quelle est ma profondeur de séquençage ?
Quel est le débit maximal d’un séquenceur Illumina actuel ?
A work by Migale Bioinformatics Facility
https://migale.inrae.fr
Our two affiliations to cite us:
Université Paris-Saclay, INRAE, MaIAGE, 78350, Jouy-en-Josas, France
Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, MIGALE bioinformatics facility, 78350, Jouy-en-Josas, France